Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME2P22392 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME2P22392 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NME2P22392 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME2P22392 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME2P22392 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NME2P22392 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME2P22392 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME2P22392 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME2P22392 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME2P22392 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME2P22392 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME2P22392 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME2P22392 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME2P22392 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME2P22392 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME2P22392 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME2P22392 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME2P22392 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME2P22392 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NME2P22392 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME2P22392 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NME2P22392 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME2P22392 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME2P22392 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME2P22392 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME2P22392 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME2P22392 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME2P22392 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME2P22392 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME2P22392 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME2P22392 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME2P22392 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NME2P22392 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NME2P22392 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME2P22392 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME2P22392 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME2P22392 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME2P22392 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME2P22392 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME2P22392 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms