Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYL4P12829 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYL4P12829 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYL4P12829 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYL4P12829 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYL4P12829 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYL4P12829 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYL4P12829 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYL4P12829 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYL4P12829 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYL4P12829 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYL4P12829 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYL4P12829 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYL4P12829 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYL4P12829 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYL4P12829 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYL4P12829 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYL4P12829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYL4P12829 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYL4P12829 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYL4P12829 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYL4P12829 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYL4P12829 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYL4P12829 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYL4P12829 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYL4P12829 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYL4P12829 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYL4P12829 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYL4P12829 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms