Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAMP11215 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms