Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARBP10826 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARBP10826 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RARBP10826 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARBP10826 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARBP10826 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARBP10826 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RARBP10826 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARBP10826 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARBP10826 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARBP10826 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARBP10826 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARBP10826 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARBP10826 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RARBP10826 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RARBP10826 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RARBP10826 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RARBP10826 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RARBP10826 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARBP10826 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARBP10826 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARBP10826 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARBP10826 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARBP10826 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RARBP10826 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARBP10826 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RARBP10826 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARBP10826 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARBP10826 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARBP10826 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARBP10826 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARBP10826 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARBP10826 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARBP10826 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARBP10826 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms