Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms