Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2P04141 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2P04141 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2P04141 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2P04141 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2P04141 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2P04141 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2P04141 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2P04141 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2P04141 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2P04141 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2P04141 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2P04141 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2P04141 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSF2P04141 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSF2P04141 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2P04141 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2P04141 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2P04141 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2P04141 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms