Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms