Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNSO60931 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNSO60931 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNSO60931 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNSO60931 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNSO60931 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNSO60931 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNSO60931 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNSO60931 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNSO60931 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNSO60931 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNSO60931 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNSO60931 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNSO60931 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNSO60931 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNSO60931 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNSO60931 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNSO60931 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNSO60931 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNSO60931 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNSO60931 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms