Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A4O43246 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.9 ms