Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A2O14975 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms