Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DFFAO00273 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DFFAO00273 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DFFAO00273 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DFFAO00273 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DFFAO00273 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DFFAO00273 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DFFAO00273 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DFFAO00273 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DFFAO00273 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DFFAO00273 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DFFAO00273 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DFFAO00273 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DFFAO00273 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DFFAO00273 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DFFAO00273 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DFFAO00273 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DFFAO00273 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DFFAO00273 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DFFAO00273 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DFFAO00273 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms