Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGTLC3B5MD39 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms