Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BECN2A8MW95 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BECN2A8MW95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN2A8MW95 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms