Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB5A8MRT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB5A8MRT5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms