Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms