Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP11Q9Y3A2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms