Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR55Q9Y2T6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPR55Q9Y2T6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms