Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.51■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC54.51■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC54.51■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC54.51■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC54.5■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.32
NISCHQ9Y2I1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC54.49■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC54.48■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC54.47■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.47■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC54.47■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC54.47■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.46■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC54.45■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC54.45■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.45■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC54.45■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.45■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC54.44■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC54.44■■■■■ 6.31
NISCHQ9Y2I1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC54.44■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC54.43■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC54.43■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC54.42■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC54.42■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC54.42■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.41■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC54.41■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC54.39■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC54.39■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC54.38■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC54.38■■■■■ 6.3
NISCHQ9Y2I1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.37■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC54.36■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC54.36■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC54.35■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC54.34■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.34■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC54.33■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.33■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC54.32■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC54.32■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.32■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.29
NISCHQ9Y2I1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC54.31■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC54.31■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC54.31■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC54.31■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC54.3■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.29■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC54.28■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC54.28■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC54.28■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC54.27■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC54.27■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.26■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC54.25■■■■■ 6.28
NISCHQ9Y2I1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC54.24■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC54.24■■■■■ 6.27
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