Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms