Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA12Q9UI09 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFA12Q9UI09 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms