Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms