Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms