Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CNTLNQ9NXG0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CNTLNQ9NXG0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CNTLNQ9NXG0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTLNQ9NXG0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms