Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC177Q9NQR7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC177Q9NQR7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC177Q9NQR7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms