Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPRD1BQ9NQG5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms