Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGQ9H9S0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGQ9H9S0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms