Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSER2Q9H7U1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
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