Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6CQ9H3T2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms