Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM39BQ9GZU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM39BQ9GZU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms