Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC2P3Q9BVR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms