Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms