Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF12Q96QT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms