Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SAMD8Q96LT4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SAMD8Q96LT4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SAMD8Q96LT4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SAMD8Q96LT4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SAMD8Q96LT4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SAMD8Q96LT4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD8Q96LT4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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