Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD1Q96JS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms