Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRELD1Q96HD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRELD1Q96HD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRELD1Q96HD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms