Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMP1Q96GC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMP1Q96GC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMP1Q96GC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VMP1Q96GC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VMP1Q96GC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VMP1Q96GC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMP1Q96GC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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