Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DTX3LQ8TDB6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3LQ8TDB6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms