Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRYD3Q8NCJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SPRYD3Q8NCJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRYD3Q8NCJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms