Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYNE4Q8N205 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNE4Q8N205 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms