Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML1Q86YW5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms