Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PPARGC1BQ86YN6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPARGC1BQ86YN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms