Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASC2Q6XLA1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms