Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC137Q6PK04 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms