Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF544Q6NX49 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms