Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3HQ6NTF7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3HQ6NTF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms