Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9B1Q4ZJI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms