Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SSX2Q16385 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SSX2Q16385 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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