Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NCOA1Q15788 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA1Q15788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
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