Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB35Q15286 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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