Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
EEA1Q15075 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
EEA1Q15075 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
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